L’étude de la biodiversité des milieux aquatiques permet notamment d’identifier et de quantifier les atteintes sur les milieux aquatiques dans le cadre de surveillances, de pollutions ponctuelles ou chroniques, de plan général d'évacuation des eaux (PGEE), de mesures d’assainissement ou de revitalisation.

Afin de diagnostiquer l’état des cours d’eau, Biol’Eau Sàrl dispose d'appareils de mesures et d’outils biologiques permettant d'évaluer l’état d’un milieu aquatique (cours d’eau, étangs ou lacs):